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Design ofg Biological Molecules and Systems

Was ist focused mutagenesis?

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- site saturation mutagenesis wird verwendet, um ein Protein zu verbessern
- zb hinsichtlich: Aktivität, Selektivität, Temperaturresistenz, pH-Profil
- eine bestimmte Genregion wird durch künstliche Gensythese durch alle möglichen Mutationen ersetzt und die Eigenschaften betrachtet -> Mutantenbibliothek
 
- wenn man Genregion eingrenzen kann, ist die Anzahl an Varianten überschaubarer
- Beispiel: eine Gensequenz mit 100 AA soll mutiert werden -> alle 20 AA kommen in Frage, also ist die Anzahl an Varianten = 20^100 = 1,267^124 -> selbst wenn man eine Million Varianten screenen würde, wäre das ein verlässigbar winziger Teil
 
- wenn man Genregion mit 6 AA mutieren will -> 64 Millionen Varianten
 
- State of the art: Austausch von maximal 3 AA -> 8000 Protein Varianten (20^3)
 
- Screening ist Stand der Technik noch eine Herausforderung