Design ofg Biological Molecules and Systems

Eigenschaften einer Alpha-Helix-Sekundärstruktur

- 3,6 Aminosäureseitenketten pro Umdrehung
- Ganghöhe: 0,54 nm pro Umdrehung
- Distanz von Calpha zu Calpha liegt bei 0,15 nm (Schiebung) und 100°
- Schiebung ist Grund dafür, dass AA, die in der Primärstruktur 3-4 Positionen auseinanderliegen, nun in direkter Nähe zueinander sind
- C=O's und NH's bilden Wasserstoffbrückebindungen (außer Seitenketten)
- Seitenketten zeigen nach außen
- alle WBB parallel zur Helixachse zeigen, haben Alpha-Helices ein Dipolmoment
- stabilisiert wird die alpha-Helix durch eine Wasserstoffbrückebindung zwischen dem n-ten Carbonylsauerstoff C=O und dem Amidproton der (n+4)-ten Aminosäure desselben Moleküls
- dazu müssen die C=O's und NH's zur Ausbildung der WBB dicht beieinander liegen -> engste KOnfiguration ist augewickelter Strang

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