Design ofg Biological Molecules and Systems

Error prone pcr -> Grenzen

- ist eine Enzymbasierte Methode
 
- Grenzen der epPCR:
-Polymerase tauscht bevorzugt bestimmte Basen gegeneinander aus -> am häufigsten A -> G bzw T - > C (Transitionen, weil es alles Purinbasen sind, die wiederum gegen Purinbasen ausgetauscht werden), Transversionen eher unwahrscheinlich
- weiterhin wird meistens nur ein Nukleotid von einem Codon ausgetauscht
- genetischer Code ist degeneriert -> mit 4 Basen und Triplett-Codierung könnte man theoretisch 64 AA codieren
- also gibt es einen Überschuss an Codierungsmöglichkeiten
- manche AA werden nur durch ein Triplett, manche durch mehrere Tripletts codiert -> kommen häufiger vor als andere
 
-> all dies schränkt die Menge an austauschbaren AA ein
 
- die mutagenen Hotspots und selten mutierten Regionen können als 3D-Map sichtbar gemacht werden

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