Design ofg Biological Molecules and Systems

Case study -> BSLA lipase (181 AA)

- Sättigungsmutagenese wurde durchgeführt
- an 341 Stellen wurde eine Substitution durchgeführt und bestimmte Eigenschaften betrachtet -> zb Beständigkeit in ionischen Flüssigkeiten (BMIM-CI)
- man konnte sehen, welche Verbesserungen von welchen EIgenschaften durch einen EINZIGEN AA-Austausch möglich ist
 
- für diesen Fall war die SSM deutlich erfolgreicher beim Finden von nützlichen Positionen als die epPCR-low oder epPCR-high
- es zeigte sich auch, dass nützliche Positionen vor allem in exposierten Bereichen der DNA zu finden waren
- Random mutagenesis erreichte nur 7-12% der nützlichen Positionen im Gegensatz zur SSM
 
 
MAIN CONCLUSIONS:
- directed evolution experiments (Zufallsbasierte Mutagenese) finden nur <20% der gewinnbringenden Positionen
- Bibliotheken mit nur einer einzigen AA-Subtitution sind wichtig um die Eigenschaften der Enzyme zu verstehen und damit auch, wie man sie stabilisieren kann
- es werden high-throughput-Verfahren und smarter evolution strategies benötigt

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